Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ATG4AQ8WYN0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ATG4AQ8WYN0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4AQ8WYN0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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