Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUFY3Q7L099 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms