Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM5Q71RC9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms