Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CXCL17Q6UXB2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms