Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms