Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTC1Q2NKJ3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms