Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA9Q16795 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms