Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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