Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPE65Q16518 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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