Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms