Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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VPS72Q15906 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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VPS72Q15906 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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VPS72Q15906 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS72Q15906 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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