Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAM2Q15035 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAM2Q15035 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAM2Q15035 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAM2Q15035 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TRAM2Q15035 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TRAM2Q15035 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAM2Q15035 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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