Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R3HDM1Q15032 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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