Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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