Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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