Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM32Q13049 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms