Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFCP2Q12800 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms