Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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