Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.4 ms