Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms