Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms