Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms