Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PITX1P78337 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PITX1P78337 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITX1P78337 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms