Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB5BP61020 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms