Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BACE1P56817 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BACE1P56817 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms