Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KPNA1P52294 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms