Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNTAP49354 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms