Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms