Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GGCXP38435 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms