Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms