Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL9P32969 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms