Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXC13P31276 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms