Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSFA2P28290 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms