Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PTPRBP23467 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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