Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FGFR3P22607 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms