Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NFKB1P19838 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NFKB1P19838 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NFKB1P19838 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NFKB1P19838 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NFKB1P19838 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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