Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYN1P17600 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SYN1P17600 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYN1P17600 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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