Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEFHP12036 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms