Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ESRRAP11474 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ESRRAP11474 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms