Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB1P11230 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB1P11230 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB1P11230 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms