Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGA3P0DJD8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms