Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CT47B1P0C2W7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms