Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms