Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms