Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms