Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED16Q9Y2X0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms