Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
L1RE1Q9UN81 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms