Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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RAB23Q9ULC3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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RAB23Q9ULC3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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RAB23Q9ULC3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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RAB23Q9ULC3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RAB23Q9ULC3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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RAB23Q9ULC3 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
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RAB23Q9ULC3 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB23Q9ULC3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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