Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VAX2Q9UIW0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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