Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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